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微生物是個體難以用肉眼觀察的微小生物的統稱，包括細菌、病毒、真菌和少數藻類等，其中大多數細菌和病毒對人類的健康有著巨大的威脅，如一些細菌會成為病原體，導致了破傷風、傷寒、肺炎、梅毒、霍亂和肺結核，狂犬病毒、HIV等病毒也給人類帶來生命危險。隨著社會經濟的發展，人們對健康生活的標準一提再提。尤其是近些年頻頻爆發的各種傳播性疾病和食品安全問題引發了人們對疾病預防和飲食安全的廣泛關注。
如今，在科學的指導下，我們已經認識到許多疾病的發作和食物問題都與微生物有著密切的關系，而由細菌、霉菌引起的食物安全問題和病毒性疾病也確實不勝枚舉。有著這個認知基礎，微生物檢測就成了當下疾病預防和飲食安全的有力保障。
以微生物檢測在食品領域的應用為例。食品微生物檢驗是食品質量管理中不可少的一步，它貫徹了“預防為主”的方針，可以有效地防止或者減少食物人畜共患病的發生，保障人們的身體健康。食品微生物檢驗是衡量食品衛生情況的重要指標之一，也是判定食品是否符合食用標準的科學依據之一。通過對食品中微生物的檢驗，我們還可以判斷食品加工環境的衛生情況，能夠對食品被細菌污染的程度作出正確的評價，為各項衛生管理工作提供科學依據。
就目前的總體狀況來看，涉及微生物檢驗的食品種類主要有：奶制品、預烹煮食品、飲用水、蛋制品、水果、谷物、嬰幼兒食品、肉及肉制品、軟體動物、禽肉、貝類、即食食品、罐頭食品、調味品、豆制品、冷凍飲品等。目前，我國衛生部頒布的食品微生物指標有菌落總數、大腸菌群和致病菌3項。
除了疾病預防和食物衛生檢查，還有一些其他領域也可能需要對微生物進行檢測。酒店、餐飲等服務行業是近些年發展得較火的領域，但它們所爆出的衛生問題也讓人感到糟心。前有某酒店衛生亂象，今又有西貝筱面村就衛生問題公開道歉，服務行業的消毒殺菌如果做的不到位，影響的是廣大群眾，其危害性不可謂不小。對這些服務型行業進行微生物檢測，保障消費者安全十分有必要。
眼下正值氣溫回升，又到了微生物生長、傳播的活躍期，不管是食品安全還是酒店衛生都面臨著更嚴峻的考驗，除了有關人員要做好衛生工作和監管工作外，我們也希望能看見更多的科學儀器參與了檢測中來。畢竟微生物檢測是光憑眼力難以企及的領域，科學的微生物檢測儀器能幫助我們做出更準確的判斷。
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